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컴퓨터쟁이/Bioinformatics8

[용어정리] IC50, EC50, potency IC50 : half maximal inhibitory concentration (IC50)의 약자로, 최대 억제 농도의 절반을 말함. 특정 생물학적 또는 생화학적 기능을 억제하는 물질의 효능을 측정한 값. EC50 : Half maximal effective concentration (EC50)의 약자로, 최대 유효 농도의 절반은 지정된 노출 시간 후 기준선과 최대 값 사이의 중간에 반응을 유도하는 약물, 항체 또는 독성 물질의 농도를 나타냄. potency 보다 더 선호되어 쓰이는편. potency : 약리학 분야에서 효능을 말함. 주어진 강도의 효과를 생성하는데 필요한 양으로 표현되는 약물 활성의 척도. 참고 : pubchemdocs.ncbi.nlm.nih.gov/glossary IC50: the .. 2021. 3. 3.
WGCNA Tutorial WGCNA 튜토리얼을 따라하면서 노션에 정리를 해보았다. 아직은 소스코드를 붙여 놓은 것 뿐이지만, 차차 설명도 추가하려고 한다. 2021.02.03. 노션 소스코드 작성 완료 // 설명 추가 예정 2021.02.04. 노션 함수 추가 내용정리 // 설명 추가 예정 내가 정리한 노션 페이지 www.notion.so/WGCNA-Tutorial-0907d39ef5814113aaa87dba4f532558 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- WGCNA 튜토리얼은 아래 사이트를 활용하였다. 원문 페이지 https://horvath.genet.. 2021. 2. 3.
[논문 정리] An end to end workflow for differential gene expression using Affymetrix microarrays [version 2; peer review: 2 approved] 논문 제목 An end to end workflow for differential gene expression using Affymetrix microarrays [version 2; peer review: 2 approved] 논문을 읽고 내 머릿 속에 좀 더 잘 넣어보려고 노션으로 정리를 했다. 티스토리로는 소스코드를 넣고 편집하는 기능이 조금 불편하여 노션으로 정리하고 링크로 공유한다. 아직 완전히 정리가 된 것은 아니지만, 우선 지금 내가 해야하는 전처리과정과, DEGs값을 구하는 방법은 아래의 논문에서 나온대로 할 것이기 때문에 좀 더 숙련되게 하기 위해서 정리를 한다. 처음 기록 : 2021.02.02 논문에 오타도 하나 발견한 것도 있고, 내가 원하는 내용만 좀 더 깔끔하게 보고 싶어서 정리.. 2021. 2. 2.
신약개발 2020 국내 시장조사 2020년 신약개발 키워드로 찾아본 국내 기술동향 링크는 참고한 기사 내용입니다. 1. 국내 정부 연구개발 현황 - 국내 바이오산업이 2020년 14조6,572억원을 기록하며 2017년 대비 24.5% 확대될 것으로 전망http://www.biotimes.co.kr/news/articleView.html?idxno=1297 - 바이오 빅데이터 구축사업 1) 바이오헬스 기술혁신을 위한 유전체, 의료임상정보 빅데이터 플랫폼을 구축하여, 질병극복과 산업발전기반을 마련 (복지부, 과기부, 산업부, '20년 150억원) http://m.yakup.com/index.html?m=n&mode=view&nid=234330 2)2만명 규모 연구용 바이오 빅데이터 구축 시범사업(‘20년 42억6700만원)http://ww.. 2020. 2. 26.
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